《Journal Of Computational Biology》雜志在中科院分區中是4區，在JCR分區中是Q2區。
中科院SCI期刊分區
中科院SCI期刊分區是由中國科學院國家科學圖書館制定的。將所有的期刊按照學科進行分類，以影響因子為標準平均分為四個等級。分區越靠前一般代表期刊質量越好，發文難度也越高。
2023年12月升級版
| Top期刊 | 綜述期刊 | 大類學科 | 小類學科 |
| 否 | 否 | 生物學 4區 |
BIOCHEMICAL RESEARCH METHODS
生化研究方法
BIOTECHNOLOGY & APPLIED MICROBIOLOGY
生物工程與應用微生物
COMPUTER SCIENCE, INTERDISCIPLINARY APPLICATIONS
計算機：跨學科應用
MATHEMATICAL & COMPUTATIONAL BIOLOGY
數學與計算生物學
STATISTICS & PROBABILITY
統計學與概率論
4區
4區
4區
4區
4區
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這表明《Journal Of Computational Biology》雜志在生物學領域具有較高的學術水平和影響力，其發表的論文質量和數量均得到了學術界的廣泛認可。
期刊WOS(JCR)分區（2023-2024年最新版）
| 按JIF指標學科分區 | 收錄子集 | 分區 | 排名 | 百分位 |
| 學科：BIOCHEMICAL RESEARCH METHODS | SCIE | Q4 | 77 / 85 |
10% |
| 學科：BIOTECHNOLOGY & APPLIED MICROBIOLOGY | SCIE | Q4 | 152 / 174 |
12.9% |
| 學科：COMPUTER SCIENCE, INTERDISCIPLINARY APPLICATIONS | SCIE | Q4 | 130 / 169 |
23.4% |
| 學科：MATHEMATICAL & COMPUTATIONAL BIOLOGY | SCIE | Q4 | 50 / 65 |
23.8% |
| 學科：STATISTICS & PROBABILITY | SCIE | Q2 | 53 / 168 |
68.8% |
| 按JCI指標學科分區 | 收錄子集 | 分區 | 排名 | 百分位 |
| 學科：BIOCHEMICAL RESEARCH METHODS | SCIE | Q3 | 62 / 85 |
27.65% |
| 學科：BIOTECHNOLOGY & APPLIED MICROBIOLOGY | SCIE | Q3 | 122 / 174 |
30.17% |
| 學科：COMPUTER SCIENCE, INTERDISCIPLINARY APPLICATIONS | SCIE | Q3 | 109 / 169 |
35.8% |
| 學科：MATHEMATICAL & COMPUTATIONAL BIOLOGY | SCIE | Q3 | 48 / 65 |
26.92% |
| 學科：STATISTICS & PROBABILITY | SCIE | Q3 | 96 / 168 |
43.15% |
WOS(JCR)分區是由科睿唯安公司提出的一種新的期刊評價指標，分區越靠前一般代表期刊質量越好，發文難度也越高。這種分級體系有助于科研人員快速了解各個期刊的影響力和地位。JCR將所有期刊按照各個學科領域進行分類，然后以影響因子為標準平均分為四個等級：Q1、Q2、Q3和Q4區。這種設計使得科研人員可以更容易地進行跨學科比較。
這進一步證明了《Journal Of Computational Biology》雜志在生化研究方法領域的卓越學術地位和影響力。
根據最新的數據，該雜志的CiteScore指數統計為3.6，SJR：0.659，SNIP：0.503，（學科類別：大類：Mathematics 小類：Computational Mathematics，分區：Q2，學科類別：大類：Mathematics 小類：Computational Theory and Mathematics，分區：Q2，學科類別：大類：Mathematics 小類：Modeling and Simulation，分區：Q2，學科類別：大類：Mathematics 小類：Genetics，分區：Q3，學科類別：大類：Mathematics 小類：Molecular Biology，分區：Q3）這表明該雜志在生化研究方法領域具有較高的學術影響力和引用率。
《Journal Of Computational Biology》雜志創刊于1994年，由UNITED STATES的Mary Ann Liebert Inc.出版商出版。作為一本享有盛譽的學術期刊，它致力于及時、準確、全面地報道國內外BIOCHEMICAL RESEARCH METHODS生化研究方法工作者在該領域的科學研究、技術革新和學術動態。
該雜志的國際標準簡稱是J COMPUT BIOL，其ISSN號為1066-5277（印刷版）和E-ISSN號為1557-8666（電子版），該雜志歡迎涉及生物學領域的原創理論、方法、技術和重要應用的稿件，并刊載了涉及生物學領域的相關欄目：綜述、論著、述評、論著摘要等。
- Synthetic Biology（CiteScore 4.5）
- Journal Of Receptors And Signal Transduction（CiteScore 6.6）
- Microbial Physiology（CiteScore 5.2）
- Mycology（CiteScore 9.1）
- Cells And Development（CiteScore 3.7）
- Plant Communications（CiteScore 15.7）
- Plant Ecology & Diversity（CiteScore 3.3）
- Journal Of Cotton Research（CiteScore 5.2）
- Cryptogamie Mycologie（CiteScore 3.7）
- Microbial Cell（CiteScore 6.4）
